1、兩者的審計(jì)目標(biāo)不同。民間審計(jì)（注冊(cè)會(huì)計(jì)師審計(jì)）目標(biāo)是財(cái)報(bào)的合法性、公允性作出評(píng)價(jià)，而內(nèi)審的目的是評(píng)價(jià)和改善風(fēng)險(xiǎn)管理、控制和公司治理流程的有效性，幫助企業(yè)實(shí)現(xiàn)其目標(biāo)。2、由于審計(jì)目標(biāo)不同，故兩者關(guān)注的重點(diǎn)領(lǐng)域也不同。即便是兩者較大的相同點(diǎn)財(cái)報(bào)，注會(huì)與內(nèi)審的關(guān)注的重點(diǎn)不同。民間審計(jì)（注冊(cè)會(huì)計(jì)師審計(jì)）主要側(cè)重點(diǎn)是會(huì)計(jì)信息的質(zhì)量和合規(guī)性，也就是財(cái)報(bào)的合法性、公允性作出評(píng)價(jià)。而內(nèi)部審計(jì)主要側(cè)重點(diǎn)是合有效性、經(jīng)濟(jì)性、合規(guī)性。3、業(yè)務(wù)范圍不同。注冊(cè)會(huì)計(jì)師審計(jì)主要是財(cái)報(bào)審計(jì)，以財(cái)報(bào)審計(jì)拓展到代編財(cái)務(wù)信息，執(zhí)行商定程序、財(cái)務(wù)咨詢(xún)等活動(dòng)。而內(nèi)部審計(jì)是以企業(yè)財(cái)務(wù)活動(dòng)為基礎(chǔ)，拓展到以管理領(lǐng)域?yàn)橹鞯囊环N審計(jì)活動(dòng)。